O novo edificio de viaxeiros, de 696 m2, sitúase sobre a laxa que cobre as vías, con dúas plataformas (210 m) que dan servizo a catro vías, dúas delas destinadas ao estacionamento dos trens de Rodalies.

A estación prioriza a sostibilidade, aproveitando a luz natural que chega a través de grandes lucernarios e a accesibilidade, con dous ascensores que conectan o vestíbulo coas plataformas, ademais de escaleiras mecánicas e fixas e itinerarios sinalizados para persoas con discapacidade visual. Así mesmo, conta con tres accesos: un desde a pasarela de conexión coa estación histórica; outro desde a ponte da rúa de Sant Adrià e un terceiro desde a pasarela de La Maquinista.

O trazado definitivo da liña de rede convencional Barcelona-Granollers-Xirona (4,3 km, dos que 2,8 km discorren soterrados) polo interior da estrutura da futura estación da Sagrera iníciase baixo o Nus de la Trinitat.

Tras un tramo ao aire libre, intérnase nun túnel, con parada na nova estación de Sant Andreu, até chegar ao interior da estación da Sagrera, onde aínda non terán parada os trens. Desde a estación da Sagrera daráselle continuidade, tamén en túnel, até El Clot.